虚拟细胞的验证:基准、基线与批评
目前的验证主要依靠基准与挑战赛。多项独立研究报告深度扰动模型尚不能稳定超越简单线性基线;文献库中尚无神经肿瘤领域虚拟细胞的临床验证报告。
如何检验结论:基准、基线、挑战赛与批评。
目前的验证主要依靠基准与挑战赛。多项独立研究报告深度扰动模型尚不能稳定超越简单线性基线;文献库中尚无神经肿瘤领域虚拟细胞的临床验证报告。
在 GlioState 对公开数据(GSE131928)的再分析中,肿瘤水平的状态构成在 Smart-seq2 与 10X 之间中等程度复现(6 个共有肿瘤、24 个肿瘤×状态值的 Spearman ρ=0.82;优势状态 6 例中 4 例一致);不使用任何特征基因的分类器在留出的 10X 细胞上还原了基于特征基因的状态判定,平衡准确率 0.75(随机水平 0.25;单标志基因基线 0.53)。这只检验状态定义的可重复性,并非对任何治疗反应或虚拟细胞模型的检验,且标签不是金标准。
关键证据: VC0059 VC0060 VC0069 VC0092 · 预印本 · 共引用 8 条