胶质母细胞瘤间充质样（MES 样）细胞状态
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研究问题
- 胶质母细胞瘤的间充质样（MES 样）状态是什么？
- 是什么驱动 GBM 细胞向 MES 样状态转变？
- 目前有模型能模拟 MES 样细胞对治疗的反应吗？
当前认识
MES 样是 Neftel 等（2019）描述的胶质母细胞瘤四种反复出现的恶性细胞状态之一。文献库中的研究将向 MES 样/间充质程序的转变与免疫相互作用、BRD2/NF-κB 信号及治疗后复发相关联；尚无文献库中的模型被证明能准确模拟 MES 样细胞的治疗反应。
Neftel 等结合 28 例肿瘤的单细胞 RNA 测序、401 例 TCGA 样本的批量数据及谱系示踪，发现 GBM 恶性细胞主要处于四种状态——NPC 样、OPC 样、AC 样与 MES 样——受微环境影响并具有可塑性。各状态比例受 CDK4、EGFR、PDGFRA 扩增及 NF1 突变影响，各自偏向特定状态（NF1 改变对应 MES 样）。 VC0059
向 MES 样状态的转变已被关联到癌细胞与免疫细胞的相互作用，以及 BRD2：在患者来源异种移植模型中，PTEN 缺失使 BRD2 被招募至 MES 基因启动子，基因敲除 BRD2 溴结构域可逆转 MES 转变并提高放射敏感性。 VC0066 VC0095
在 86 对患者配对的原发-复发 GBM 中，复发肿瘤表现为向间充质表型转变，并由 AP-1 介导。这是复发时的观察结果，本身不能区分该状态是由治疗诱导还是被治疗筛选。 VC0069
在空间上，细胞状态组织为局部环境与分层结构，缺氧似乎是驱动因素；GBmap 报告缺氧依赖的生态位与不良预后相关。 VC0061 VC0060 VC0094
建模现状：scFOCAL 将 GBM 细胞状态与 LINCS L1000 药物特征谱关联，以预测状态特异的敏感与耐药，论文中有体外、离体和体内验证。但文献库中尚无模型被证明能准确模拟 MES 样细胞对放疗或化疗的反应；通用基准显示深度扰动模型尚不能稳定超越简单线性基线。 VC0132 VC0048 VC0049
证据图谱
原始研究与数据集
- VC0059 An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma. — Neftel C et al., Cell, 2019
- VC0066 Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma. — Hara T et al., Cancer cell, 2025
- VC0095 BRD2 bromodomain-mediated regulation of cell state plasticity modulates therapy response in glioblastoma. — Vadla R et al., Neuro-oncology, 2025
- VC0069 A single-cell atlas of glioblastoma evolution under therapy reveals cell-intrinsic and cell-extrinsic therapeutic targets. — Wang L, Jung J, Babikir H, Shamardani K, Jain S, Feng X, Gupta N, Rosi S, Chang S, Raleigh D, Solomon D, Phillips JJ, Diaz AA., Nature cancer, 2022
- VC0061 Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma. — Greenwald AC et al., Cell, 2024
- VC0060 Charting the single-cell and spatial landscape of IDH-wild-type glioblastoma with GBmap. — Ruiz-Moreno C et al., Neuro-oncology, 2025
- VC0094 Hypoxia coordinates the spatial landscape of myeloid cells within glioblastoma to affect survival. — Haley MJ et al., Science advances, 2024
- VC0092 · 预印本 Mapping the spatial architecture of glioblastoma from core to edge delineates niche-specific tumor cell states and intercellular interactions — Khan SM et al., bioRxiv, 2025
相关模型与工具
- VC0132 Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations — Suter et al., Nature Communications, 2026
- VC0072 A method for in silico exploration of potential glioblastoma multiforme attractors using single-cell RNA sequencing. — Vieira Junior MG, de Almeida Côrtes AM, Gonçalves Carneiro FR, Carels N, Silva FABD., Scientific reports, 2024
- VC0001 How to build the virtual cell with artificial intelligence: Priorities and opportunities. — Bunne C et al., Cell, 2024
扰动与验证证据
- VC0070 In vivo perturb-seq of cancer and microenvironment cells dissects oncologic drivers and radiotherapy responses in glioblastoma. — Liu SJ et al., Genome biology, 2024
- VC0048 Deep-learning-based gene perturbation effect prediction does not yet outperform simple linear baselines. — Ahlmann-Eltze C, Huber W, Anders S., Nature methods, 2025
- VC0049 Benchmarking foundation cell models for post-perturbation RNA-seq prediction. — Csendes G, Sanz G, Szalay KZ, Szalai B., BMC genomics, 2025
本页引用文献库条目 14 条，其中预印本（未经同行评审）1 条。
关系
实体之间的类型化关系，每条均有文献库条目支撑（角色＝该条目与关系的关联方式）。低置信度行需编辑复核。 全部实体 →
| 主语 | 关系 | 宾语 | 置信度 | 证据（角色） |
|---|---|---|---|---|
| NF1 | 相关 | 间充质样状态 | 高 | VC0059 支持 |
| BRD2 | 促进 | 间充质样状态 | 高 | VC0095 支持 证据来自患者来源异种移植与细胞模型：PTEN 缺失使 BRD2 被招募至 MES 基因启动子，溴结构域敲除逆转 MES 转变。 |
| BRD2 | 经…验证 | 患者来源异种移植模型 | 高 | VC0095 支持 在患者来源异种移植中检验；尚未在患者中证实。 |
| BRD2 | 相关 | 放射治疗 | 中 | VC0095 支持 在异种移植中，基因敲除 BRD2 溴结构域提高了放射敏感性。 |
| PTEN | 抑制 | 间充质样状态 | 低 | VC0095 支持 仅由功能缺失的表述推断（“PTEN 缺失使 BRD2 被招募至 MES 基因启动子”）；文献库文本并未说明完整的 PTEN 抑制 MES 样状态。需复核。 |
| AP-1 转录因子复合物 | 促进 | 间充质样状态 | 中 | VC0069 支持 报告其介导复发肿瘤的间充质转变；这是复发时的观察，不能区分治疗是诱导还是筛选了该状态。 |
| NF-κB 信号通路 | 相关 | 间充质样状态 | 低 | VC0095 支持 取自专题摘要（“BRD2/NF-κB 信号”）；NF-κB 的具体表述未对照论文独立复核。需复核。 |
| 缺氧 | 相关 | 间充质样状态 | 低 | VC0061 支持 VC0094 支持 文献库文本称细胞状态分层似受缺氧驱动，并未将缺氧特异地与 MES 样状态绑定。需复核。 |
| 放射治疗 | 相关 | 间充质样状态 | 低 | VC0069 支持 复发 GBM 在治疗后出现间充质转变，但治疗是诱导还是筛选 MES 样细胞尚未解决。 |
| 神经祖细胞样状态 | 转变为 | 间充质样状态 | 低 | VC0066 支持 VC0059 支持 文献库称癌-免疫相互作用驱动向 MES 样状态的转变且细胞可在 Neftel 状态间移动，但未指明起始状态；此处对三种非 MES 状态均作标注，待复核。 |
| 少突胶质前体细胞样状态 | 转变为 | 间充质样状态 | 低 | VC0066 支持 VC0059 支持 文献库称癌-免疫相互作用驱动向 MES 样状态的转变且细胞可在 Neftel 状态间移动，但未指明起始状态；此处对三种非 MES 状态均作标注，待复核。 |
| 星形胶质细胞样状态 | 转变为 | 间充质样状态 | 低 | VC0066 支持 VC0059 支持 文献库称癌-免疫相互作用驱动向 MES 样状态的转变且细胞可在 Neftel 状态间移动，但未指明起始状态；此处对三种非 MES 状态均作标注，待复核。 |
本页涉及的实体
- 星形胶质细胞样状态 细胞状态
- AP-1 转录因子复合物 通路与程序
- BRD2 基因
- CDK4 基因
- EGFR 基因
- GBmap 数据集
- 胶质母细胞瘤 疾病
- 缺氧 通路与程序
- LINCS L1000 药物特征谱 数据集
- 简单线性基线 方法与概念
- 间充质样状态 细胞状态
- Neftel 四状态框架 方法与概念
- NF-κB 信号通路 通路与程序
- NF1 基因
- 神经祖细胞样状态 细胞状态
- 少突胶质前体细胞样状态 细胞状态
- PDGFRA 基因
- 患者来源异种移植模型 模型
- PTEN 基因
- 放射治疗 方法与概念
- scFOCAL / ISOSCELES 模型
- 单细胞 RNA 测序 方法与概念
- State 模型
尚不确定之处
Neftel 的“MES 样”、复发时的“间充质表型”与空间定义的生态位状态彼此相关但并不等同，结论未必可互相迁移。 VC0059 VC0069 VC0092 · 预印本
在患者体内，治疗是诱导 MES 样转变还是筛选已有的 MES 样细胞，现有引用文献尚未解决。 VC0069
机制性结论（如 BRD2）来自异种移植与细胞模型；从肿瘤核心到边缘的空间状态来自预印本。 VC0095 VC0092 · 预印本
文献库中未发现针对 MES 的策略或 MES 状态模型的前瞻性临床验证。
仅供科研与教育参考，不构成医疗建议，也不构成对任何诊疗或产品的推荐。患者请咨询主治医生。