Perturb-seq（扰动单细胞测序）
别名: perturb-seq · in vivo Perturb-seq
单细胞扰动筛选方法。小鼠 GBM 模型中的体内 CRISPRi Perturb-seq 沉默了肿瘤生长驱动基因与放疗敏化基因；K562/RPE1 的全基因组规模 Perturb-seq 是虚拟细胞模型的主要训练资源。 VC0070 VC0040 VC0045 · 预印本
待审阅 版本 0.1.0 · 状态：初稿 · 最近专家审阅：尚未审阅
关系
| 主语 | 关系 | 宾语 | 置信度 | 证据（角色） |
|---|---|---|---|---|
| Perturb-seq | 扰动 | 胶质母细胞瘤 | 高 | VC0070 支持 小鼠 GBM 模型中的体内 Perturb-seq；结论未必适用于人类肿瘤。 |
出现在研究专题中
- 胶质母细胞瘤单细胞与空间数据集 (数据集)
- 胶质母细胞瘤扰动数据：放疗、药物与 CRISPR (扰动)
- 胶质母细胞瘤的治疗诱导可塑性 (状态转变)
出现在文献库条目中（7）
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- VC0139 · 预印本 Engineered regulatory states resolve context-dependent genetics in macular degeneration — Metzner E, Guruvayurappan K, Southard KM, Ardy RC, Dey KK, Norman TM., bioRxiv, 2026
- VC0110 Causal Models Need Causal Data - Xaira's X-Cell (podcast) — Latent Space, Latent Space podcast, 2026
- VC0046 · 预印本 Scalable probe-based single-cell transcriptional profiling for virtual cell perturbation mapping and synthetic biology phenotyping — Swinderman JT et al., bioRxiv, 2026
- VC0045 · 预印本 X-Atlas/Orion: Genome-wide Perturb-seq Datasets via a Scalable Fix-Cryopreserve Platform for Training Dose-Dependent Biological Foundation Models — Huang AC et al., bioRxiv, 2025
- VC0070 In vivo perturb-seq of cancer and microenvironment cells dissects oncologic drivers and radiotherapy responses in glioblastoma. — Liu SJ et al., Genome biology, 2024
- VC0040 Mapping information-rich genotype-phenotype landscapes with genome-scale Perturb-seq. — Replogle JM et al., Cell, 2022
- VC0103 Arc Institute Virtual Cell Initiative — Arc Institute, web
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